ศูนย์ไข้หวัดใหญ่แห่งชาติ (Thai National Influenza Center) กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ เป็นห้องปฏิบัติการเครือข่ายเฝ้าระวังไข้หวัดใหญ่ที่ได้รับการแต่งตั้งจาก องค์การอนามัยโลก (WHO) ตั้งแต่ พ.ศ. 2515 โดยมีบทบาทและหน้าที่ในการเฝ้าระวังการเปลี่ยนแปลงของตัวเชื้อไวรัสไข้หวัดใหญ่และส่งตัวอย่างเชื้อที่มีความผิดปกติหรือเปลี่ยนแปลงไปจากเดิมส่งไปยังองค์การอนามัยโลกอย่างสม่ำเสมอ หลังจากประเทศไทยมีการระบาดของไข้หวัดนกเป็นครั้งแรกในปี พ.ศ. 2546 ศูนย์ไข้หวัดใหญ่แห่งชาติได้รับการประสานงานจากองค์การอนามัยโลกและศูนย์ควบคุมป้องกันโรคแห่งชาติสหรัฐอเมริกา ให้จัดฝึกอบรมทางห้องปฏิบัติการให้แก่เจ้าหน้าที่ห้องปฏิบัติการในกลุ่มเครือข่ายขององค์การอนามัยโลกหลายครั้ง รวมถึงไข้หวัดใหญ่สายพันธุ์ใหม่ 2009 ทำให้องค์การอนามัยโลกยอมรับในศักยภาพและได้แต่งตั้งศูนย์ไข้หวัดใหญ่แห่งชาติขึ้นเป็น ห้องปฏิบัติการอ้างอิงในภูมิภาคเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ขององค์การอนามัยโลกด้านไข้หวัดใหญ่ (WHO Regional Influenza Reference Laboratory for the South-East Asia Region : WHO RIRL ) เมื่อวันที่ 22 มิถุนายน 2553